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植物科研的 “连环扣”:核酸提取是基础,转录组测序是核心!
做植物分子生物学研究的小伙伴都有过这样的经历:耗时数周收集样本,却因核酸提取失败导致后续测序功亏一篑;或是测序数据拿到手,却发现因 RNA 纯度不足,差异基因分析结果不可信…… 其实,植物科研的成功,离不开 “核酸提取试剂” 与 “植物转录组重测序” 的完美配合 —— 前者是保证样本质量的 “第一道防线”,后者是挖掘基因密码的 “核心工具”,两者环环相扣,缺一不可!
无论是解析植物抗逆机制、挖掘优良性状基因,还是加速育种进程,从样本处理到测序分析的每一步都需精准把控。今天就带大家解锁这套 “黄金组合”的使用秘诀,让你的植物科研少走弯路、高效出成果!
第一步:选对核酸提取试剂,给转录组测序 “打牢地基”
植物样本(叶片、根、茎、果实等)向来是提取难题:细胞壁坚硬、多酚多糖含量高、富含 RNase 酶,稍不注意就会导致 RNA 降解、纯度不足,直接影响转录组测序的数据质量(如 mapping 率低、差异基因假阳性高等)。因此,针对植物样本的核酸提取,必须满足 “精准适配” 原则!
广州赛百纯生物科技有限公司推出了多糖多酚植物RNA提取试剂盒,多酚植物RNA提取试剂盒(磁珠法)II型,适用于从200mg的各类植物组织材料(简单及复杂植物的根、茎、叶、花、果实、种子等)中快速提取RNA。样本经匀浆处理后,整个操作流程仅需15分钟。本试剂盒采用创新独特的裂解系统,能够有效地去除植物组织中普遍存在的多糖、多酚物质,在迅速裂解植物组织的同时,对细胞释放出的核酸酶起到良好的抑制作用,从而确保所提取RNA的完整性。本试剂盒提取得到的RNA可直接应用于RT-PCR、Northern Blot、Dot Blot、体外翻译等实验。
多酚植物RNA提取试剂盒 (磁珠法)II型
特点和优势:
· 适用范围广
在独特裂解液的帮助下,可以提取大多数多糖多酚植物的RNA,也包括非多糖多酚植物的RNA;
· 去除DNA
含有DNase I ,能够彻底去除DNA,防止对下游实验的干扰;
· 所得RNA纯度高
可直接应用于RT-PCR、Northern Blot、Dot Blot、体外翻译、分子克隆、芯片分析等生物学实验。
· 操作简单快速,节约时间
前处理只需要15min就可以完成,后续只需要上机就可以完成提取。
实验结果:
1、使用SUP261602、公司A产品和公司B产品对不同植物组织样本进行RNA提取,结果显示SUP261602提取得到的RNA收量较多,纯度较好。
2、1.2%琼脂糖凝胶电泳
第二步:植物转录组重测序,解锁基因表达的 “隐藏密码”
当你通过优质试剂获得高纯度 RNA 后,植物转录组重测序就能发挥最大价值 —— 它通过高通量测序技术,全面分析植物在特定条件下的基因表达谱、差异基因、可变剪切等信息,是连接 “样本” 与 “科研结论” 的核心桥梁。
转录组重测序的核心应用(结合核酸提取)
1.植物抗逆机制研究
例:分析干旱胁迫下玉米叶片的转录组数据,需先通过植物专用试剂提取高质量 RNA,才能精准筛选出抗旱相关差异基因(如 ABA 信号通路基因),明确玉米的抗旱调控网络。
2.优良性状基因挖掘
例:对比高产与低产水稻的转录组差异,需保证提取的 RNA 无杂质干扰,才能准确鉴定出与产量相关的关键基因(如光合效率基因),为分子育种提供靶点。
3.植物发育阶段分析
例:研究番茄果实从青涩到成熟的转录变化,需提取不同发育时期果实的 RNA(全程无 RNase 污染),通过转录组测序追踪乙烯合成相关基因的表达动态,解析果实成熟机制。
核心总结:高效科研的 “两大关键”
• 核酸提取试剂是 “基础保障”:选对植物专用试剂,才能获得高质量 RNA,让转录组测序数据更可靠;
• 转录组重测序是 “核心工具”:精准分析基因表达信息,才能将样本数据转化为科研成果。
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