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卡盒式的最大优势在于封闭无污染，这对于临床应用来说，不仅节省了医院PCR实验室分区的工程建设成本，且避免了样本间的交叉污染及实验室环境中的气溶胶污染问题。但其通量比较低，每台仪器一个月只能运行264个样本（数据来源于思路迪），对于样本通量高的三甲医院来说，这个样本通量足足不够。另外，根据卡盒的设计图，小编推测一次建库成本较高，在肿瘤基因检测一个样本收费几千至上万元的基础，再增加成本，可能在临床大规模推广过程中将受到阻碍。
移液工作站方式最大的优势在于兼容各种试剂，临床医生可以选择不同厂家的试剂进行基因检测，不受厂家限制，以利于成本和质量控制，同时通量灵活多变，适应于大中小样本通量。但它是一个开放式平台，如同在超净台内操作，受到实验室环境影响，且在一个工作站内无法进行PCR前后区的操作，除非物理上的隔离。
二种方法各有优劣势，移液工作站是现阶段使用量较多的一种自动化方案，小编在此推荐LH-1808 全自动液体处理工作站
具有可整合性强、移液头自动切换、高性价比、高开放性、液体处理功能全面等特点。
可整合扫码模块，自动液位探测模块，磁分离模块，多功能温控模块，震荡模块。
用于NGS样品前处理、血站、检验检疫、法医、药物筛选等多个行业领域。
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